Ein besonderes Anliegen der Umweltstiftung Stuttgarter Hofbräu ist die Unterstützung von Maßnahmen zum Schutz und zur Wiederherstellung von Gewässern. Dies kann beispielsweise das naturnahe Gestalten von betonierten Quellfassungen sein, aber auch die Renaturierung kleiner Bäche, Tümpel und Weiher.
Eine solche Maßnahme war die Entschlammung des Naturdenkmals „Schwarzer See“, einem Tümpel auf dem Lemberg bei Affalterbach Anfang 2013.
Die markante dunkle Wasserfärbung ist namengebend für den „Schwarzen See“. Um 1970 war dieser noch ein wichtiger Lebensraum für geschützte Tierarten wie Teichmolch, Feuersalamander und Erdkröte. Im Laufe der Jahre verschlammte der Tümpel jedoch immer mehr. Außerdem verdeckte Laub und Holz die ehemals offene Wasserfläche zusehends, sodass dort in letzter Zeit keine Amphibien mehr leben konnten.
Ein Projekt zum Schutz von Gewässern, welches die Umweltstiftung Stuttgarter Hofbräu mehrmals unterstützt hat, ist die Sicherung und Renaturierung von Teilen der Saalbachniederung nordwestlich von Bruchsaal.
Die Sanierung des „Schwarzen Sees“ ist ein klassisches Förderprojekt im Sinne der Umweltstiftung. Während die Stiftung die Maschinenkosten des Baggers in Höhe von 2.500 € übernahm, wurden die bei der Sanierung des Tümpels anfallenden Arbeiten ehrenamtlich von der Jugendfeuerwehr Affalterbach durchgeführt. Klar, dass die Stiftung die Jugendfeuerwehr auch noch zu einem Vesper eingeladen hat und einen Scheck zur Durchführung weiterer derartiger Arbeiten im Sinne des Naturschutzes übergab.